碗莲种子在水中浸泡的时间可以根据不同的情况而有所变化。以下是一些常见的处理方法：

1. 短暂浸泡：有些碗莲种子不需要长时间浸泡即可发芽。您可以将种子放入温水中，浸泡30分钟到1小时左右，然后取出进行播种。

2. 长时间浸泡：另一种方法是让碗莲种子在水中浸泡更长的时间，通常为24小时或更长。这将帮助种子充分吸水以促进发芽。

3. 冷处理：对于某些种类的碗莲种子，在冷处理过程中将种子置于湿润的材料（如纸巾）上，然后放入冰箱中保存一段时间。这样的处理可以模拟种子经历寒冷季节的自然条件，激发种子破裂休眠并增加发芽率。

具体浸泡时间可能因品种、种子质量和环境条件而异。在浸泡之前，确保检查每个品种的种植说明书或种子包装上的建议。如果没有明确的指导，根据您的判断选择适当的浸泡时间，并密切观察种子的状态以确定何时开始播种。