樱桃树冬季休眠期病虫害综合防治应采用人工和农业的方法，清理果园，消除越冬病虫害源，有效消除有害生物，降低越冬基础。
1、清扫落叶：落叶是许多病虫害的主要越冬部位之一，如樱桃褐斑、黑色轮纹病等病菌在受害叶片上越冬，卷叶蛾等害虫潜伏在受害叶片上越冬。樱桃落叶结束后，彻底清理落叶，掩埋或直接堆肥，消除落叶越冬病虫害，可大大降低次年病虫害基数。
2、结合修剪，切除病虫枝：冬季修剪是樱桃树管理的重要技术措施也是休眠期消除越冬病虫害的有效途径。修剪合理，可调节树体负荷，改善果园通风透光条件，促进果树健康生长，提高抗病虫能力。结合修剪，剪掉卷叶蛾、桃蚜、瘤蚜、红蜘蛛等树枝上的病虫害，集中烧毁修剪后的病虫害树枝，消除越冬病虫害。
3、深刨树盘：树冠下的土壤许多越冬病虫害潜伏在土壤冻结前，深挖树盘，一些食心虫、梨花网虫、梨星毛虫、舟形毛虫可以直接杀死土壤中越冬的部分，山楂红蜘蛛(冬季雌成螨在根颈周围的土壤间隙、落叶和杂草之间越冬)等。通过翻土，一些害虫可以暴露在土壤表面。这些害虫要么被鸟啄，要么在寒冷的冬天冻死。
4、刮去翘皮、粗皮、病瘤：树干上的翘皮和粗皮是病虫害的主要越冬场所，如山红蜘蛛(冬型雌成螨)、卷叶蛾、梨小食心虫、梨星毛虫等都在翘皮、粗皮下越冬。刮去翘皮和粗皮可以消除上述大部分害虫。刮除根癌病瘤和流胶病胶块，用于根癌1%硫酸铜、80@2抗菌剂乳油50用双液或刮除病斑40%福美砷可湿性粉剂30双液涂抹伤口，流胶病用50%退菌特50g 50%硫悬浮剂250g混合涂药。对减少来年的感染来源有很好的作用。对减少来年的感染来源有很好的作用。
5、保护伤口，封闭锯切口：冬季修剪留在树上的伤口不仅是病菌入侵的途径，也是一些害虫越冬的地方。加入适量猪油调和清漆或桐油，涂抹保护伤口，防止病菌入侵。